技术服务
Technical Service
宏转录组测序
  • 宏转录组(metatranscriptomics)是指在特定环境(如土壤,粪便等)和特定时期全部生物(微生物)表达基因的总和。宏转录组测序(metatranscriptomics sequencing)是借助于高通量测序技术,对特定生境特定时空下微生物群落中活跃菌种的组成以及活性基因的表达情况进行研究的方法,与宏基因组测序相比,宏转录组测序更加侧重于活跃表达的功能基因的种类及生物学功能。

    技术优势:

    1)揭示微生物功能的动态变化。宏转录组测序能够实时监测微生物群落在不同环境刺激下的转录反应,揭示微生物对环境变化的适应机制和功能变化。与传统的宏基因组测序技术不同,宏转录组不仅分析微生物群落的结构,还能深入探讨其活跃基因的表达情况,提供更加精准的功能注解。

    2)高通量与多样性分析能力。该技术具有超高的检测通量和灵敏度,能够在一个实验中同时捕获大量微生物的基因转录数据。对于复杂环境中的微生物群落(如土壤、肠道、环境样品等),宏转录组能够识别出微生物的基因表达模式。

    3)功能预测与潜力挖掘。通过宏转录组数据的深度挖掘,能够识别微生物群落中的关键功能基因,帮助研究者揭示特定微生物在微生态系统中的角色及其潜在的生物活性。这对于微生物功能的精准预测,尤其是在环境修复、疾病研究等领域,具有重要意义。

    4)技术成熟且日益普及。随着测序平台和数据分析技术的不断进步,宏转录组测序的成本和数据处理难度逐渐降低,已成为微生物群落研究中不可或缺的技术工具。该技术的日益成熟和广泛应用,使其成为解决微生物学和生态学复杂问题的重要手段。

    技术路线:

    image.pngimage.png

    宏转录组测序实验及分析流程图

    技术参数:

    提供illumina 2×150bp测序数据:

    1.数据量≥ 10G raw data/样本;

    2.Q30 >80%。








copyright © 2008-2023 昊为泰 reserved. ICP备案序号:沪ICP备18028200号-1沪公网安备 31011502016782号